Врач-психиатр проводит процедуры ТМС при депрессиях, тревожных расстройствах (включая посттравматическое стрессовое расстройство и обсессивно-компульсивное расстройство), когнитивных нарушениях, болевом синдроме (синкопальная мигрень и фибромиалгия) и некоторых неврологических заболеваниях.